注意选择药剂的剂型。药剂浸种用的是药剂的稀释液，所用药剂一定要溶于水。目前溶于水的药剂加工剂型有可湿性粉剂、水剂、乳剂和悬胶剂。不能用粉剂浸种，因为粉剂不溶于水，药粉浮于水面或下沉，种子粘药不匀，达不到浸种灭菌效果。
准确配制药液。浸种所用的药剂浓度不是根据种子重量计算的，一般是按照药剂的有效成分含量计算。浸种的药剂浓度一般和浸种时间有关，浓度低浸种时间可略长一点，浓度高浸种时间要缩短，如果不准确掌握好浓度，就容易发生药害或降低浸种效果。
掌握浸种时间。药剂浸种有一定的时间要求，过长会产生药害，过短达不到消毒目的。具体浸种时间要根据药品使用说明进行操作。
浸过的种子要冲洗和晾晒。对药剂忍受力差的种子在浸过后，应按要求用清水冲洗，以免发生药害。如果没有具体说明浸后水洗，就不必水洗。不论需要还是不需要水洗，浸后都应摊开晾干，有的也可以浸后直接播种，这要依农药种类和土壤墒情而定。
药液面要高出种子。在浸种时，药液要高出种子16厘米以上，以免种子吸水膨胀后露出药液外，降低浸种效果。
充分搅拌。种子放入药液中要充分搅拌，排除药液内的气泡，使种子与药液充分接触，提高浸种效果。
